Αρχικά στον κ. Μαγουλά είχε επιβληθεί από τον Γενικό Γραμματέα της Περιφέρειας Αττικής η πειθαρχική ποινή της αργίας 15 ημερών για σοβαρή παράβαση των καθηκόντων του. Η ποινή αυτή στη συνέχεια μειώθηκε από τον υπουργό Εσωτερικών το 2008.
Η πειθαρχική ποινή επιβλήθηκε, καθώς το 2006 ο κ. Μαγουλάς δεν απάντησε σε αλλεπάλληλες επιστολές του Συνηγόρου του Πολίτη σχετικά με παράνομες επιχωματώσεις που είχαν γίνει στην Μαρίνα του Πόρτο Ράφτη από την επιχείρηση φύλαξης σκαφών.