Μετά από χρόνια μάχη με τον καρκίνο, ο Στέφαν Μπεκενμπάουερ άφησε την τελευταία του πνοή σε ηλικία 46 ετών
Ο γιος του θρύλου του παγκοσμίου ποδοσφαίρου είχε καταγράψει 12 συμμετοχές στη Μπουντεσλίγκα με την ομάδα της Σααρμπρίκεν, ενώ έπαιξε επίσης στη Μόναχο 1860 και τους ερασιτέχνες της Μπάγερν, όμως η καριέρα του τελείωσε άδοξα σε ηλικία 29 ετών λόγω ενός τραυματισμού στο γόνατο.
Ακολούθησε καριέρα προπονητή και από το 2009 έως το 2012 ήταν στην ομάδα Under 17 της Μπάγερν. Ο Στέφαν Μπεκενμπάουερ ήταν παντρεμένος και είχε τρεις γιους.