Όπως με τα βακτήρια αναπτύσσουν αντοχή στα αντιβιοτικά, έτσι και οι ιοί μπορούν να αναπτύξουν αντοχή στα εμβόλια.
Η εξέλιξη και οι μεταλλάξεις του ιού SARS-CoV-2 (νέος κορονοϊός) θα μπορούσαν να υπονομεύσουν την αποτελεσματικότητα των εμβολίων που βρίσκονται υπό ανάπτυξη, σύμφωνα με έρευνα που δημοσιεύθηκε στο επιστημονικό περιοδικό PLOS Biology από τους David Kennedy και Andrew Read από το πανεπιστήμιο της Πενσυλβανίας, ΗΠΑ. Οι συγγραφείς προσφέρουν επίσης προτάσεις στους προγραμματιστές εμβολίων για την ελαχιστοποίηση της πιθανότητας αυτού του αποτελέσματος.