Οι εργαζόμενοι υποστηρίζουν ότι η εφαρμογή των άρθρων του Προεδρικού Διατάγματος, περιορίζει την αυτονομία του ΕΟΠΥΥ και τον καθιστά πλήρως ελεγχόμενο από το υπουργείο Υγείας.
Ο πρόεδρος των εργαζομένων του ΕΟΠΥΥ Κώστας Κερασίδης ανέφερε ότι «ο Οργανισμός ενσωματώνεται ουσιαστικά σε αυτόνομο τμήμα του υπουργείου Υγείας, από όπου και θα περνούν όλες οι αποφάσεις.
Οι εργαζόμενοι η άμεση εφαρμογή των ρυθμίσεων οι οποίες περιορίζουν τις αρμοδιότητες του ΕΟΠΥΥ, μπορεί και να καταστήσουν αμφίβολο ακόμη και τον αριθμό των σημερινών θέσεων εργασίας».
Ο γενικός γραμματέας του υπουργείου Γιώργος Γιαννόπουλος, σε δηλώσεις του τόνισε πως οι εργαζομένοι δεν έχουν ενημερωθεί σωστά, δεν τίθεται θέμα και χαρακτήρισε την κινητοποίηση εκτός τόπου και χρόνου.