Αν και στις περισσότερες περιπτώσεις ο στρεπτόκοκκος στον λαιμό μπορεί να αντιμετωπιστεί με φαρμακευτική αγωγή, σε σπάνιες περιπτώσεις, η μόλυνση είναι γνωστό ότι προκαλεί πιο σοβαρές επιπλοκές. Για παράδειγμα, ο στρεπτόκοκκος στον λαιμό μπορεί να οδηγήσει σε μετα-στρεπτοκοκκική σπειραματονεφρίτιδα (μια φλεγμονή των νεφρών), οστρακιά και ψωρίαση.
