Στις αρχές της δεκαετίας του 2000 ήρθε στα χέρια των αμερικανών αξιωματούχων “η τελευταία ακριβής πληροφορία για το πού μπορεί να βρίσκεται” ο Μπιν Λάντεν, δήλωσε ο Πανέτα σε πρόγραμμα του αμερικανικού δικτύου ABC. “Έκτοτε είναι πολύ δύσκολο να πάρουμε οποιαδήποτε πληροφορία όσον αφορά την ακριβή τοποθεσία στην οποία βρίσκεται”, σημείωσε. “Κρύβεται, όπως είναι προφανές, πολύ βαθιά. Βρίσκεται σε κάποια περιοχή όπου ζουν φυλές στο Πακιστάν”.
Όσον αφορά τον πόλεμο στο Αφγανιστάν, ο Πανέτα έδωσε μια πολύ συγκρατημένη απάντηση, λέγοντας ότι “οι Ταλιμπάν δείχνουν να γίνονται ισχυρότεροι. Όμως η πραγματικότητα είναι ότι εμείς υπονομεύουμε την ηγεσία τους και αυτό πιστεύω δείχνει ότι κινούμαστε προς τη σωστή κατεύθυνση”.